Çfarë duhet të dini
- Një skedar FNA është një skedar i ADN-së me format FASTA dhe rreshtimit të sekuencës së proteinave.
- Hap një me Geneious.
- Konverto në FASTA dhe formate të ngjashme me të njëjtin program.
Ky artikull shpjegon se çfarë është një skedar FNA, si të hapet një dhe si të ruhet një në një format tjetër si FASTA, GB, VCF, imazhe, etj.
Çfarë është një skedar FNA?
Një skedar me shtrirjen e skedarit FNA është një skedar i ADN-së me format FASTA dhe rreshtimit të sekuencës së proteinave që ruan informacionin e ADN-së që mund të përdoret nga softueri i biologjisë molekulare.
Skedarët FNA, në mënyrë specifike, mund të përdoren për të mbajtur vetëm informacionin e acidit nukleik ndërsa formatet e tjera FASTA përmbajnë informacione të tjera të lidhura me ADN-në, si ato me FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ shtesat e skedarëve, NET ose AA.
Këto formate FASTA të bazuara në tekst fillimisht dolën nga një paketë softuerësh me të njëjtin emër, por tani përdoren si standard në aplikacionet e rreshtimit të sekuencave të ADN-së dhe proteinave.
FNA gjithashtu i referohet disa termave teknologjikë që nuk kanë të bëjnë fare me këtë format skedari, si pranimi përfundimtar i rrjetit, lehtësia e rritjes së emrit/atributit, arkitektura e rrjetit Fujitsu dhe reklama e shpejtë e fqinjëve.
Si të hapni një skedar FNA
Hap një në Windows, macOS dhe Linux me Geneious (është falas për 14 ditë). Për ta bërë këtë, lundroni te menyja File > Import dhe zgjidhni të importoni skedarin nëpërmjet Nga Skedariartikull i menysë.
Mund të jeni gjithashtu në gjendje të hapni një me BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Provo Notepad++ ose një redaktues tjetër teksti nëse këto ide nuk po funksionojnë. Skedari mund të jetë me të vërtetë i bazuar në tekst dhe i thjeshtë për t'u lexuar, ose mund të zbuloni se nuk ka të bëjë fare me formatin FASTA, në të cilin rast hapja e skedarit si një dokument teksti mund të zbulojë tekstin që identifikon atë që është përdorur për të krijuar skedarin ose në çfarë formati është skedari.
Si të konvertohet një skedar FNA
Nuk mund ta verifikojmë këtë pasi nuk e kemi provuar, por duhet të jeni në gjendje të përdorni Geneious për të kthyer skedarin në shumë formate të tjera, si FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV dhe VCF. Kjo mund të bëhet përmes menysë File > Export të programit.
I njëjti program duhet gjithashtu të jetë në gjendje të ruajë skedarin në PNG, JPG, EPS ose PDF, nëpërmjet File > Ruaj si skedar imazhi.
Megjithëse normalisht nuk mund ta riemërtoni shtesën e një skedari në diçka tjetër dhe të prisni që ai të funksionojë në të njëjtën mënyrë, mund ta riemërtoni një skedar. FNA në një skedar. FA nëse softueri juaj i veçantë i sekuencës së ADN-së do ta njohë vetëm formati FA.
Në vend që të riemërtoni shtesat e skedarëve, do të dëshironi të përdorni një konvertues skedarësh falas për të konvertuar lloje të tjera skedarësh. Në rastin me skedarët FNA dhe FA, ndodh që disa programe të hapin vetëm skedarë që kanë shtesën e skedarit FA, në këtë rast riemërtimi i tij duhet të funksionojë mirë.
Ende nuk mund ta hap?
Nëse pas përdorimit të programeve nga lart, ende nuk mund ta hapni skedarin tuaj, mund të zbuloni se zgjerimi i skedarit nuk lexon në të vërtetë. FNA, por përkundrazi diçka që thjesht duket e ngjashme.
Për shembull, skedarët FNG (Font Navigator Group) duken shumë sikur thonë ". FNA", por nëse shikoni nga afër, vetëm dy shkronjat e para janë të njëjta. Meqenëse shtesat e skedarëve janë të ndryshme, është një tregues se ato janë të një formati skedari të ndryshëm dhe me shumë mundësi nuk do të funksionojnë me të njëjtat programe.
E njëjta gjë mund të thuhet për shumë shtesa të tjera skedarësh si FAX, FAS (Përpiluar Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Funksionet Vue) dhe FND (Windows Saved Search).
Ideja këtu është që thjesht të sigurohemi që zgjerimi i skedarit të lexojë. FNA. Nëse po, provoni përsëri të përdorni programet nga lart për ta hapur ose konvertuar atë. Nëse keni një lloj skedari tjetër, hulumtoni shtrirjen e tij për të gjetur se cilat aplikacione nevojiten për ta hapur ose konvertuar atë.
FAQ
Si hapni një skedar FNA në Python?
Së pari, konvertoni skedarin FNA në formatin FASTA duke përdorur një aplikacion të palës së tretë si Geneious. Më pas, mund të shkarkoni Biopython, një grup mjetesh të disponueshme falas për llogaritjen biologjike për punë në bioinformatikë. Së fundi, referojuni Udhëzuesit Biopython dhe Librit të Gatimit për udhëzime mbi punën me skedarët FASTA.
Si mund t'i gjej numrat e mi të krijuesit FNA në një skedar të papërpunuar të Ancestry?
Mund të shkarkoni shumicën e të dhënave të ADN-së nga Ancestry.com në formatin.txt. Megjithatë, vetëm klientët, ADN-ja e të cilëve është analizuar me sekuencën e gjeneratës së ardhshme (NGS) kanë mundësinë të shkarkojnë një skedar VCF. Për të shkarkuar një skedar VCF, duhet të jeni pronari i ADN-së, të keni testuar ADN-në duke përdorur teknologjinë NGS dhe të keni të paktën 350 MB hapësirë të disponueshme në pajisjen tuaj.
